Новый алгоритм ускорит разработку вакцин и лекарств в десятки раз

Команда ученых из России, США и Франции разработала сверхбыстрый метод моделирования белковых взаимодействий, ускоряющий разработку вакцин и лекарств и открывающий новые возможности для исследователей в биохимии и биомедицине.


Многие современные лекарства имеют побочные эффекты – помимо лечения больного органа, они воздействуют на органы и клетки, которые не нуждаются в этом. Главный вопрос — как быстрее доставить лекарство к больным клеткам организма, где оно начнет взаимодействие с нужными белками.


Белок – основной строительный материал клетки. В каждой клетке живого организма одновременно происходят сотни тысяч белковых взаимодействий. Их изучение помогает учёным и лучше понять, как лекарство «укладывается» в клетку, и создать новые биометриалы для изобретения медикаментов.


В мире разработаны десятки компьютерных систем прогнозирования для расчета белок-белкового взаимодействия, но они плохо приспособлены для моделирования большого количества взаимодействий одновременно: каждый комплекс требует много часов работы суперкомпьютера и финансовых затрат. Эти проблемы и побудили команду учёных разработать новый сверхбыстрый метод моделирования белковых взаимодействий.



«В течение нескольких лет совместной работы нам удалось разработать и реализовать алгоритм, который способен в десятки раз быстрее аналогичных систем предсказывать структуры белковых комплексов, образующихся при связи двух белков друг с другом. Новый метод позволяет практически мгновенно провести анализ одновременно всех комплексов, что ускоряет процесс в 10-100 раз. При этом точность вычислений не ухудшается», — рассказывает один из авторов работы профессор Ярослав Холодов.



Статья с описанием метода опубликована в журнале PNAS.


Кстати, воспользоваться алгоритмом может любой желающий – он стал новой вычислительной начинкой публичного сервера ClusPro, созданного той же командой ученых.


Как отмечает Ярослав Холодов, данная разработка – удобный инструментарий для людей, занимающихся фундаментальной наукой, которые, благодаря открытому доступу к сервису, могут вывести свои исследования на новый уровень.

Powered By WizardRSS.com | Full Text RSS Feed

Источник

Rating Form ID 1 does not exist!

Автор публикации

не в сети 5 дней

Невинномысск

Комментарии: 0Публикации: 33574Регистрация: 24-01-2012

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *